Foi fundada na década de 1914 pela familia Hydra, que descobrem o Progenitor Virus (uma espécie de vírus RNA - Vírus Progenitor).
Entre outros empreendimentos (vários ilícitos) a Hydra trabalha com pesquisa e fabricação de armas. O T-virus - arma química - capaz de reanimar os mortos e responsável pelo surgimento das criaturas do jogo, é um produto da Hydra, mas na legalidade ela trabalha como uma indústria farmacêutica.
Para manter a segurança de seus investimentos a Hydra suborna autoridades e financia a candidatura de políticos favoráveis. A Hydra guarda muitas semelhanças com a empresa real Halliburton, inclusive o fato de ambas terem um corpo de mercenários particular.